Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHOX2BQ99453 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHOX2BQ99453 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms