Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC85AQ96PX6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC85AQ96PX6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms