Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM20AQ96MK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM20AQ96MK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM20AQ96MK3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms