Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C9orf85Q96MD7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms