Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C12orf66Q96MD2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf66Q96MD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms