Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX27Q96L92 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX27Q96L92 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX27Q96L92 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms