Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCC12Q96J65 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ABCC12Q96J65 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC12Q96J65 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms