Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM17Q96I25 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM17Q96I25 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM17Q96I25 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM17Q96I25 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RBM17Q96I25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RBM17Q96I25 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
RBM17Q96I25 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM17Q96I25 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM17Q96I25 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM17Q96I25 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM17Q96I25 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RBM17Q96I25 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms