Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF31Q96EP0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF31Q96EP0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF31Q96EP0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF31Q96EP0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF31Q96EP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF31Q96EP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF31Q96EP0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms