Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC127Q96BQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC127Q96BQ5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC127Q96BQ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms