Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TRIM63Q969Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM63Q969Q1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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TRIM63Q969Q1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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TRIM63Q969Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM63Q969Q1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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