Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TOP1MTQ969P6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TOP1MTQ969P6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TOP1MTQ969P6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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