Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL2Q92772 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL2Q92772 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms