Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN4Q92575 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN4Q92575 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBXN4Q92575 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms