Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSPC1Q8WXF1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPC1Q8WXF1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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