Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAJA4Q8WW22 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DNAJA4Q8WW22 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJA4Q8WW22 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms