Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
DDX54Q8TDD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDX54Q8TDD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDX54Q8TDD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDX54Q8TDD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms