Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APPL2Q8NEU8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
APPL2Q8NEU8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms