Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT3

TMEM145, Transmembrane protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM145Q8NBT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM145Q8NBT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM145Q8NBT3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM145Q8NBT3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms