Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4F7

RNF175, RING finger protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF175Q8N4F7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF175Q8N4F7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF175Q8N4F7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF175Q8N4F7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms