Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
VWDEQ8N2E2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
VWDEQ8N2E2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VWDEQ8N2E2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VWDEQ8N2E2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms