Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT2Q8IXI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT2Q8IXI1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT2Q8IXI1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms