Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
P3H3Q8IVL6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
P3H3Q8IVL6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
P3H3Q8IVL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
P3H3Q8IVL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms