Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM50Q86XT4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM50Q86XT4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM50Q86XT4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms