Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37DQ86XT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37DQ86XT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37DQ86XT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms