Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMC6Q7Z403 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMC6Q7Z403 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms