Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTF1AQ7RTS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTF1AQ7RTS3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTF1AQ7RTS3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms