Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C4orf50Q6ZRC1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C4orf50Q6ZRC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf50Q6ZRC1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf50Q6ZRC1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf50Q6ZRC1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C4orf50Q6ZRC1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms