Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYHR1Q6ZMK1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CYHR1Q6ZMK1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CYHR1Q6ZMK1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms