Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CD109Q6YHK3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CD109Q6YHK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
CD109Q6YHK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CD109Q6YHK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms