Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTHFD1LQ6UB35 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTHFD1LQ6UB35 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTHFD1LQ6UB35 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms