Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA3EQ6PEY2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBA3EQ6PEY2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBA3EQ6PEY2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms