Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGB2Q6NT52 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGB2Q6NT52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms