Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RCSD1Q6JBY9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCSD1Q6JBY9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms