Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM200BQ69YZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms