Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA2Q69YH5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDCA2Q69YH5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA2Q69YH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms