Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LARP1BQ659C4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LARP1BQ659C4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms