Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EEF1DP3Q658K8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1DP3Q658K8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1DP3Q658K8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EEF1DP3Q658K8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms