Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND4CQ5VZ89 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENND4CQ5VZ89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENND4CQ5VZ89 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms