Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ECM29Q5VYK3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ECM29Q5VYK3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ECM29Q5VYK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ECM29Q5VYK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms