Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF542PQ5EBM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF542PQ5EBM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms