Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF628Q5EBL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF628Q5EBL2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.9 ms