Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC1Q4ZHG4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC1Q4ZHG4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms