Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC36A3Q495N2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A3Q495N2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms