Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ODF3L2Q3SX64 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3L2Q3SX64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms