Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TWISTNBQ3B726 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TWISTNBQ3B726 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms