Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-BQ31612 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-BQ31612 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms