Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LAMA3Q16787 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMA3Q16787 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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