Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNA1EQ15878 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNA1EQ15878 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms