Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIV2LQ15477 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2LQ15477 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms